Kontinentální zóny

Evropa

O 13 míst, která byla v Německu rezervována pro evropské týmy (kromě Německa), se v kvalifikačních zápasech utkalo celkem 52 mužstev. Ta byla rozlosována do osmi skupin, z nichž tři měly 7 členů a zbylých pět mělo po 6 členech. Itálie, Francie, Anglie a Španělsko měly kvůli vysokému zastoupení svých týmů v evropských pohárech jistotu, že budou vylosovány do některé šestičlenné skupiny. Systém kvalifikace je obvyklý - týmy se utkají každý s každým doma - venku a vítěz každé ze skupin má zajištěný přímý postup na finálový turnaj. Dva nejlepší týmy z těch, které skončí na druhém místě (přičemž v sedmičlenných skupinách se nebere v potaz výsledek dosažený s týmem, který skončí na posledním místě ve skupině), si taktéž zajistí přímý postup do Německa, zatímco zbylá mužstva z druhých míst jsou rozlosována do dvojic a o své místo na šampionátu se utkají v barážovém dvojzápase.

Postupují:
Německo, Ukrajina, Polsko, Chorvatsko, Anglie, Portugalsko, Itálie, Nizozemsko, Švédsko, Srbsko a Černá Hora, Francie, Česká republika, Španělsko, Švýcarsko

Afrika

O 5 míst na finálovém turnaji se ucházelo celkem 52 týmů. Africká kvalifikace byla dvoukolová - 5 týmů, které se kvalifikovaly na minulé mistrovství (Kamerun, Nigérie, Jihoafrická republika, Senegal, Tunisko), a 4 další, nejvýše postavené v žebříčku fotbalové federace (Maroko, Egypt, Pobřeží slonoviny a Demokratická republika Kongo), byly nasazeny přímo do druhého kola. Zbylých 42 mužstev bylo rozlosováno do dvojic, které se na podzim 2003 utkaly v dvojzápase stylem doma-venku o postup do druhého kola.
Druhé kolo bylo hráno klasickým turnajovým systémem, týmy byly rozlosovány do pěti skupin po šesti členech (týmy, které se účastnily minulého MS, byly nasazeny každý do jiné skupiny), ve kterých se utkaly každý s každým dvakrát a vítěz každé skupiny postupuje na závěrečný turnaj do Německa.

Postupují:
Togo, Tunisko, Pobřeží slonoviny, Ghana, Angola

Asie

V Asii se na závěrečném turnaji utkalo 44 zemí o 4,5 místa. Eliminačního prvního kola kvalifikace se zúčastnilo 14 nejhůře postavených týmů v žebříčku fotbalové federace, které se na podzim 2003 utkaly systémem doma-venku a vítěz postoupil do druhého kola. V tom byly týmy rozlosovány do osmi čtyřčlenných skupin, jejichž vítězové postoupili do kola třetího. Ti byli rozděleni do dvou čtyřčlenných skupin, týmy na prvním a druhém místě si zajistily účast na závěrečném turnaji, týmy na třetím místě se utkaly v barážovém dvojzápase, a vítěze tohoto dvojzápasu čekala ještě baráž s týmem ze zóny Severní a Střední Amerika a Karibská oblast. Baráž dopadla vítězně pro tým z konkurenční zóny. Asie si tak na šampionát zajistila nakonec jen 4 místa.

Postupují:
Japonsko, Jižní Korea, Írán, Saúdská Arábie

Jiřní Amerika

Kvalifikační systém zóny Jižní Amerika je i díky nízkému počtu členů nejpřímočařejší - 10 zúčastněných celků se utkalo systémem doma-venku každý s každým (tým tak odehrál celkem 18 zápasů), první čtyři týmy postupují přímo do Německa, tým na páté příčce se utkal s vítězem kvalifikace Oceánie. Jižní Amerika si v kvalifikačních zápasech zajistila z původních 4,5 místa nakonec jen 4 místa, a zajistila tak jedno místo na letošním mistrovství i Oceánii.

Postupují:
Argentina, Brazílie, Ekvádor, Paraguay

Severní a Střední Amerika a Karibská oblast

V této zóně bylo 35 kandidátů na 3,5 postupového místa. Postupující vzešli zřejmě z nejsložitější kvalifikace ze všech systémů - týmy rozdělené podle koeficientů fotbalové federace byly rozlosovány do trojic, z nichž dva slabší týmy se utkaly o možnost vyzvat nejsilnější tým, a vítěz tohoto dvojzápasu postoupil do druhého kola. V tom bylo 12 týmů rozděleno do tří skupin po čtyřech celcích. Vždy týmy z prvního a druhého místa v každé skupině postoupily do třetího kola, kde se utkaly každý s každým doma-venku a první tři si zajistily postup do Německa. Mužstvo ze čtvrtého místa se utkalo v barážovém dvojutkání s jedním asijským týmem. Asijský tým v barážovém dvojutkání nakonec této zóně podlehl, a zóna Severní a Střední Amerika a Karibská oblast tak mohla vyslat na MS do Německa celkem 4 mužstva.

Postupují:
USA, Mexiko, Kostarika, Trinidad a Tobago

Oceánie

Oblast Oceánie měla pro svých 12 týmů zaručeno na závěrečném turnaji pouze 0,5 místa. Austrálie a Nový Zéland byly nasazeny do druhého kola, zbylých 10 mužstev bylo rozlosováno do dvou skupin, ve kterých se utkalo každé s každým (jednou) na turnaji, který proběhl od 10. do 19. května 2004. Dva nejlepší týmy z každé skupiny se společně s Austrálií a Novým Zélandem zúčastnily dalšího turnaje (29. května - 6. června), jehož vítěz a druhý v pořadí se utkali v dvojzápase doma-venku o postup do baráže s celkem z Jižní Ameriky. Baráž skončila vítězně pro Oceánii. Na letošní mistrovství tak díky vítěznému zápasu postoupila Austrálie.

Postupují:
Austrálie